Nadzor nad odvzetimi in presajenimi organi/tkivi je zelo temeljit. Izvajata ga Slovenija-transplant in Eurotransplant. Nadzor se začne že v operacijski sobi, kjer darovalcu odvzamejo organe. Transplantacijski koordinator, ki je vedno prisoten pri odvzemu, dokumentira prav vsak odvzeti organ/tkivo. Evidenco odvzetih organov vodita hkrati Slovenija-transplant in ET. Transplantacijski koordinator tudi dokumentira vsak organ/tkivo, ki je bil presajen v Sloveniji ter vsak organ, ki ga je Slovenija-transplant izročil ET oz. ga je od tam dobil. Če kateri od organov/tkiv zaradi neustreznosti in neskladnosti ni bil presajen, se ga uniči pred komisijo in izda posebno potrdilo o uničenem organu. Podpisniki tega potrdila so odgovorni strokovnjaki, ki ga ET pošlje Slovenija-transplantu ali obratno.